Een nadeel van het eten van dieren is in principe dat het geen efficiënte manier van voeden is. Voordat een dier voor consumptie geschikt is, heeft het erg veel plantaardig voedsel gegeten, dat de mens ook direct had kunnen eten. Wetenschappers hebben berekend dat – afhankelijk van diersoort en omstandigheden – 3 tot 10 kilo plantaardig eiwit nodig is om tot 1 kilo vleeseiwit te komen. Door eerst de dieren te voeren, wordt 85% van de plantaardige eiwitten verspild.

Vlees belast de darmen omdat het moeilijk te verteren is. Vooral de stof haem in rood vlees is een belasting voor de darmen. Het eten van meer dan 500 gram rood vlees per week (rund-, varkens- en lamsvlees) is een risico voor het ontwikkelen van darmkanker.

Vlees bevat veel arachidonzuur dat een belangrijke rol bij ontstekingen speelt. Een overmaat aan arachidonzuur is ontstekingsbevorderend en ontsteking is een van de oorzakelijke factoren die een rol spelen bij kanker. Bovendien bevat ons vlees, van dieren uit de bio-industrie, ook veel linolzuur. Evenals arachidonzuur is ook linolzuur nodig voor de mens maar niet in de huidige hoeveelheden, dan blijkt linolzuur ook ontstekingsbevorderend. Dit hangt vooral samen met de verhouding tussen omega-3 vetzuren en omega-6 vetzuren (vooral linolzuur). Zie hiervoor ook de informatie over vetten op deze site. Daarnaast bevat vlees van dieren die een onnatuurlijk en weinig bewegend leven hebben gekend meer verzadigd vet. Dat is weliswaar niet direct kankerverwekkend, maar leidt via overgewicht toch makkelijker tot een verhoogde kans op kanker.

Wild vlees, van wilde dieren die in een gezonde omgeving hebben geleefd, is waarschijnlijk veel gezonder dan industrieel geproduceerd vlees. Vlees van wild bevat minder verzadigde vetten, minder omega-6 vetzuren (zoals linolzuur) en meer omega-3 vetzuren (zoals alfa-linoleenzuur).

Kip en ander gevogelte bevat geen haem en is over het algemeen mager vlees. Daarom is gevogelte vaak een goed alternatief. Echter, niet als dit afkomstig is uit de bio-industrie; met enige regelmaat worden we opgeschrikt door berichten over besmetting van mensen door het eten van kippenvlees met de salmonella bacterie of de aanwezigheid van antibiotica. (om over te veel dioxine in eieren nog maar te zwijgen).

In principe bevatten biologische eieren geen dioxines en het is inmiddels alweer enkele jaren bekend dat de hoeveelheid cholesterol in eieren niet of nauwelijks bijdraagt aan een verhoogde cholesterolspiegel in het bloed. Eieren bevatten een bescheiden hoeveelheid eiwit, maar dat is wel nuttig eiwit voor mensen. Een biologisch eitje per dag is dus een goede aanvulling van de voeding.